Zanim Pani porażenie osiągnie etap kompletnego udaru radzę zapoznać się z tym dość przystęnym artykułem, który – w przeciwieństwie do dyrdymał opowiadanych przez ramola Dakowskiego – wprowadzi Panią zdziebko w świat współczesnych rozważań nad matematycznymi i termodynamicznymi aspektami ewolucji:
któremu zawdzięczamy nowatorskie spojrzenie na rolę procesów nieodwracalnych (entropowych) w ewolucji, które badał zarówno w skali ewolucji molekuł (enzymów, gdzie wartość stałej Michaelisa-Menten jest dobrą miarą dostosowania ewolucyjnego), jak i całych populacji gatunków.
Specjalnie dla Pani przygotowałem do ściągnięcia prezentację w Power Pointcie zawiarającej zwięzłe przedstawienie jego teorii ukierunkowań, która jawi się współcześnie jako najpoważniejsza fizyko-matematyczna teoria ewolucji:
In finite populations it was shown that the dynamics of invasion is a stochastic process which is predicted by the parameter evolutionary entropy, a measure of the demographic stability or robustness of the population. This demographic parameter has been integrated with Mendelian genetics to develop a dynamical theory of evolution called directionality theory. This theory predicts relations between ecological constraints and life-history variables and provides a framework for explaining the diversity of physiological and morphological properties which exist in natural populations.
A tak dla czystej przyjemności mam dla Pani małe ćwiczonko intelektualne pt. “od nauki do ideologii”.
Tutaj jest artykuł źródłowy z dobrego pisma PHYSICALREVIEW LETTERS:
jest jego pierwsze amerykańskie omówienie “ludzkim językiem” – już z drobnymi elementami ideologicznymi w tle, ale jeszcze bez przegięć – jedynie ze wskazaniem, że wypowiedziane popularyzatorskim językiem zdanie jednego z odkrywców (Chakrabartiego):
Control theory offers a direct explanation for an otherwise perplexing observation and indicates that evolution is operating according to principles that every engineer knows.
zwróciło uwagę kreacjonistów od “inteligentnego projektu” i autorzy odkrycia poczuli się zmuszeni odżegnać od tego doborowego towarzystwa:
The scientists do not know how the cellular machinery guiding this process may have originated, but they emphatically said it does not buttress the case for intelligent design, a controversial notion that posits the existence of a creator responsible for complexity in nature.
Ale tutaj już jest wszystko poprzekręcane, pomylone są zasadnicze pojęcia a cały sens odkrycia odwrócony do góry nogami:
W tekstcie głównym (artykule naukowym) znajdujemy klarownie zdefiniowany cel badawczy, omówione niedostaki dotychczasowych modeli (termodynamicznych) oraz korzyści płynące z zastosowania z wykładanej w kusie automatyki przemysłowej teorii kontoli do procesów biologicznych i tego konsekwencje dla teorii ewolucji:
A current challenge in evolutionary theory is to identify how the fitness measures of complex biological systems depend on the physical properties
of their constituent proteins. In the hierarchical evolution of protein networks, biological self-organization influences the dynamics that occur on shorter time scales. Although most theories of evolutionary dynamics have modeled evolution as a dynamical
system seeking to optimize a potential or free energy, multi-time-scale evolution of protein networks may be modeled within a broader framework as a control
problem. Optimal control (OC) theory is generally concerned with the determination of the time-dependent functional form of the Hamiltonian of a controlled dynamical system that maximizes a desired objective function. An important difference between a dynamical system and a control system is that the latter distinguishes between the free dynamics of the system and the dynamics regulated by controls. In the present case, these controls can take the
form of functional protein properties. The evolution of a biological system may be modeled as a control system if the regulatory functional properties of its constituent proteins coevolve with the network’s overall function. Should the evolutionary dynamics of such a system demonstrate features indicative of optimal controls, this would constitute evidence that the system’s evolution has attained a sophisticated level of self-organization amounting to the solution of an OC problem. Here, we show that application of this theory to active site mutations
in an enzyme network of central importance for metabolism—the electron transport chain—indicates that the redox potentials of electron transport proteins are controlling the evolutionary dynamics of this network in an optimal
fashion, providing insight into the self-organization of this system.
Natomiast z artykułu dla “inteligentnych inaczej” zamieszczonym na portalu kreacjonistów cała sytuacja wygląda jednak tak, jakby fakt, że zachowanie białek nie jest przypadkowe, lecz spełnia oczekiwania teorii kontroli był sam w sobie jakimś zaprzeczeniem zdrowego rozsądku czy też wymykał się możliwościom natury aż tak, że sami badacze bezradnie rozkładają nad tym faktem ręce a tylko głupio uśmiechając się idą w zaparte i pomimo tak oczywistego “dowodu” na to, że mamy do czynienia z “inteligentnym projektem” twierdzą (bezpodstawnie) co innego.
Tak właśnie robi się kreacjonistyczną “krytykę” badań nad ewolucją – z jednej strony twierdzi się, że nie ma co badać, bo “matematycy przecież udowodnili, że w sposób abiotyczny życie powstać nie mogło” a jak jednak systematyczne badania naukowe pokażą w końcu nieoczekiwane możliwości natury, wciąż wynikające jednak z podstawowych praw fizyki, to się odwraca kota ogonem i mówi, że skoro tak fantastycznie to wszystko samo działa, to musiał to być “inteligentny projekt”. Tak kreacjoniści pasożytują na prawdziwej nauce sami nie mając nic, ale to nic do zaproponowania.
Polecam lekturę, jeśli w maglu cokolwiek jeszcze się czyta…
@Magia
Zanim Pani porażenie osiągnie etap kompletnego udaru radzę zapoznać się z tym dość przystęnym artykułem, który – w przeciwieństwie do dyrdymał opowiadanych przez ramola Dakowskiego – wprowadzi Panią zdziebko w świat współczesnych rozważań nad matematycznymi i termodynamicznymi aspektami ewolucji:
http://www.plosbiology.org/article/info:doi/10.1371/journal.pbio.0050142
Zwracam przede wszystkim uwagę na ważne nazwisko LLoyda Demetriusa:
http://en.wikipedia.org/wiki/Lloyd_Demetrius
któremu zawdzięczamy nowatorskie spojrzenie na rolę procesów nieodwracalnych (entropowych) w ewolucji, które badał zarówno w skali ewolucji molekuł (enzymów, gdzie wartość stałej Michaelisa-Menten jest dobrą miarą dostosowania ewolucyjnego), jak i całych populacji gatunków.
Specjalnie dla Pani przygotowałem do ściągnięcia prezentację w Power Pointcie zawiarającej zwięzłe przedstawienie jego teorii ukierunkowań, która jawi się współcześnie jako najpoważniejsza fizyko-matematyczna teoria ewolucji:
www.ziggi.pl/other/demetrius/demetrius.ppt
Zwięźle:
In finite populations it was shown that the dynamics of invasion is a stochastic process which is predicted by the parameter evolutionary entropy, a measure of the demographic stability or robustness of the population. This demographic parameter has been integrated with Mendelian genetics to develop a dynamical theory of evolution called directionality theory. This theory predicts relations between ecological constraints and life-history variables and provides a framework for explaining the diversity of physiological and morphological properties which exist in natural populations.
A tak dla czystej przyjemności mam dla Pani małe ćwiczonko intelektualne pt. “od nauki do ideologii”.
Tutaj jest artykuł źródłowy z dobrego pisma PHYSICAL REVIEW LETTERS:
www.ziggi.pl/other/demetrius/evolution_prl.pdf
Tutaj natomiast:
www.ziggi.pl/other/demetrius/evol_news_summary.pdf
jest jego pierwsze amerykańskie omówienie “ludzkim językiem” – już z drobnymi elementami ideologicznymi w tle, ale jeszcze bez przegięć – jedynie ze wskazaniem, że wypowiedziane popularyzatorskim językiem zdanie jednego z odkrywców (Chakrabartiego):
Control theory offers a direct explanation for an otherwise perplexing observation and indicates that evolution is operating according to principles that every engineer knows.
zwróciło uwagę kreacjonistów od “inteligentnego projektu” i autorzy odkrycia poczuli się zmuszeni odżegnać od tego doborowego towarzystwa:
The scientists do not know how the cellular machinery guiding this process may have originated, but they emphatically said it does not buttress the case for intelligent design, a controversial notion that posits the existence of a creator responsible for complexity in nature.
Ale tutaj już jest wszystko poprzekręcane, pomylone są zasadnicze pojęcia a cały sens odkrycia odwrócony do góry nogami:
http://creationism.org.pl/teoria_kontroli
W tekstcie głównym (artykule naukowym) znajdujemy klarownie zdefiniowany cel badawczy, omówione niedostaki dotychczasowych modeli (termodynamicznych) oraz korzyści płynące z zastosowania z wykładanej w kusie automatyki przemysłowej teorii kontoli do procesów biologicznych i tego konsekwencje dla teorii ewolucji:
A current challenge in evolutionary theory is to identify how the fitness measures of complex biological systems depend on the physical properties
of their constituent proteins.
In the hierarchical evolution of protein networks, biological self-organization influences the dynamics that occur on shorter time scales. Although most theories of evolutionary dynamics have modeled evolution as a dynamical
system seeking to optimize a potential or free energy, multi-time-scale evolution of protein networks may be modeled within a broader framework as a control
problem. Optimal control (OC) theory is generally concerned with the determination of the time-dependent functional form of the Hamiltonian of a controlled dynamical system that maximizes a desired objective function.
An important difference between a dynamical system and a control system is that the latter distinguishes between the free dynamics of the system and the dynamics regulated by controls. In the present case, these controls can take the
form of functional protein properties.
The evolution of a biological system may be modeled as a control system if the regulatory functional properties of its constituent proteins coevolve with the network’s overall function. Should the evolutionary dynamics of such a system demonstrate features indicative of optimal controls, this would constitute evidence that the system’s evolution has attained a sophisticated level of self-organization amounting to the solution of an OC problem.
Here, we show that application of this theory to active site mutations
in an enzyme network of central importance for metabolism—the electron transport chain—indicates that the redox potentials of electron transport proteins are controlling the evolutionary dynamics of this network in an optimal
fashion, providing insight into the self-organization of this system.
Natomiast z artykułu dla “inteligentnych inaczej” zamieszczonym na portalu kreacjonistów cała sytuacja wygląda jednak tak, jakby fakt, że zachowanie białek nie jest przypadkowe, lecz spełnia oczekiwania teorii kontroli był sam w sobie jakimś zaprzeczeniem zdrowego rozsądku czy też wymykał się możliwościom natury aż tak, że sami badacze bezradnie rozkładają nad tym faktem ręce a tylko głupio uśmiechając się idą w zaparte i pomimo tak oczywistego “dowodu” na to, że mamy do czynienia z “inteligentnym projektem” twierdzą (bezpodstawnie) co innego.
Tak właśnie robi się kreacjonistyczną “krytykę” badań nad ewolucją – z jednej strony twierdzi się, że nie ma co badać, bo “matematycy przecież udowodnili, że w sposób abiotyczny życie powstać nie mogło” a jak jednak systematyczne badania naukowe pokażą w końcu nieoczekiwane możliwości natury, wciąż wynikające jednak z podstawowych praw fizyki, to się odwraca kota ogonem i mówi, że skoro tak fantastycznie to wszystko samo działa, to musiał to być “inteligentny projekt”. Tak kreacjoniści pasożytują na prawdziwej nauce sami nie mając nic, ale to nic do zaproponowania.
Polecam lekturę, jeśli w maglu cokolwiek jeszcze się czyta…
A sam się już definitywnie żegnam.
Zbigniew P. Szczęsny -- 01.11.2009 - 22:07